对于历史性的两岸首次直航，大陆表现得很低调，虽然给予七百多名首批直航台胞诸多入境和通关方便，但到码头迎接的官员职位不高，也没欢迎仪式，就是居于厦门的金门人到场拉起欢迎横额，也被公安驱赶。随香客到福州的台湾记者更一度被拒上岸，几经斡旋才可入境，但不能携带摄影器材。
悄悄降下青天白日旗
面对大陆的冷淡反应，加上「海安号」前天因彼岸的反对而被迫中途折返，为免节外生枝，从金门出发的「太武号」在启航前已悄悄降下船尾的「中华民国国旗」。对此，在金门料罗码头送船的台湾高雄港务局局长游万来说，这是依循「香港模式」，小三通往来船只不挂国旗。
福建派船领航入码头
金门的「太武号」、「浯江号」和马祖的「台马」轮在进入大陆海域后，福建方面派出领航船前来领航，也有海关人员上船检查团员证件，码头上则分别有厦门市台办主任孔长才和福州台办副主任林吉忠迎迓，但没有欢迎仪式，与过去高规格、热情款待台胞的做法相比，这次的接待规格显然不高。马祖来客走上码头时，更只得零星的欢迎掌声。
禁记者携摄影机入境
大陆的低调还可证诸传媒的报道。虽然这是历史性盛事，但国内传媒事前只字未提，福建电视台昨晚也只是简短报道。对于二十一名随马祖香客来福州的台湾记者，大陆方面认为他们未获台办允许，属「违规」采访，原要将他们送返马祖，协调后才答应让他们上岸，但不能带摄影器材，要随团活动，不能单独采访。
苹果日报3日综合报道(http://renminbao.com)