該組織的最新週年報告名爲「公元二千年新聞界所受攻擊」,長達五百五十頁,當中列舉了全球超過六百個新聞自由遭挑戰的個案,其中有兩頁是描述香港新聞界情況。
報告詳述三宗曾轟動香港新聞界的事件,當中包括去年三月有線電視在臺灣舉行總統選舉後,播出當選副總統的呂秀蓮的訪問,指臺灣與中國大陸是「遠親」後,即時惹來中聯辦副主任猛烈抨擊,並「教導」香港新聞界不能報導有關臺灣獨立與西藏獨立的消息,其後記協收到八百多名記者簽名,誓言不做宣傳機器。
報告指很多觀察家認爲事件已逐步削弱了他們在江澤民的「一國兩制」下對香港新聞自由的信心,認爲是「鼓勵」香港記者在處理大陸新聞時自我審查。
報告接着列舉去年十月,大陸國家主席江澤民在北京接見往述職的特首董建華時,被問及是否已欽點董作爲第二屆特首時,當着電視鏡頭,怒斥香港記者「Too imple, Sometimes naive」(太簡單,有時更是太幼稚)。多份報章都認爲江澤民是自壞聲譽,報告指此舉正顯示中、港兩地政治文化的差異。
最後,報告指前《南華早報》中國版編輯林和立,因報導觸怒老闆而被迫辭職,此舉被很多人視爲江澤民不滿香港傳媒的徵兆。
中文大學亞太研究所副所長劉兆佳表示,部分傳媒因經濟及政治等種種原因而自我約束,實屬無可厚非,因爲不能期望每個人都勇往直前。
他又說江澤民正因爲不滿意香港傳媒才發怒,顯示香港傳媒敢於批評。
但浸會大學新聞系助理教授杜耀明認爲,中聯辦副主任及江澤民事件顯示,當江澤民對香港傳媒超越容忍極限時,往往表現很奇異的態度。他認爲不應對北京存在不必要的幻想,強調新聞自由是要爭取得來的。