軍方隱瞞疫情是造成北京疫情擴散的原因，「華盛頓郵報」引述消息人士表示，溫家寶在巡視疾病控制預防中心時，批評軍方隱瞞疫情，並且強調要告訴人民實情。日前一名退休的北京外科醫生蔣彥勇曾寫一封公開信指責三○一醫院隱瞞疫情，另一名中共疾病控制預防中心的官員也批評，如果不是軍方醫院一開始隱瞞疫情，北京目前的SARS疫情也不會這麼嚴重。
此外，數星期前當SARS疫情在北京猖獗時，北京市領導也對中央隱瞞實際疫情，一名西方大使指出，這就好像華盛頓的疫情已相當嚴重，但白宮卻渾然不知。世界衛生組織（ＷＨＯ）在北京辦公室發言人也說，中共中央的確不知道疫情。
其實，中南海里的中共高層領導裏有許多「北京幫」，例如前北京市書記賈慶林，他是現任中共九名政治局常委之一，另外，現任北京市書記劉淇爲中共政治局委員之一，他們會向胡、溫兩人隱瞞疫情並不奇怪。
前中共衛生部長張文康也是了解北京市實情的其中一人，三月廿七日北京一名病毒學家畢山林（音）曾警告張文康辦公室裏的一名高層官員，「ＳＡＲＳ將爲北京帶來災難，我們必須想想辦法。」
但是這名官員告訴他，部裏已經知道這件事。畢山林又強調，他們得先和政府其他部門協調。最後北京告訴中央，「沒有問題」，「我們可以處理，小事一樁」，畢山林指出，隔天一堆醫護人員都感染了SARS。
一名衛生部官員說，北京不如其它省市尊重中央，在很多問題上似乎毫不在意。鄧小平死後沒幾年，江澤民就將其親信賈慶林調任北京，最終形成了眼下親江的「北京幫」。
不久之後，胡錦濤以中共中央軍委副主席的身份，要求軍方醫院公佈實際的感染人數，四月廿日中共衛生部副部長高強公佈初步的統計數字，人數大幅攀升，隔天張文康隨即丟官，但胡錦濤的人前北京市長孟學農也跟着下臺。
不過，大陸消息人士表示，胡錦濤和溫家寶對軍方的壓力迫使他們不得不直接面對江澤民，至今江澤民對於疫情仍未做出任何回應，江澤民只是在上海與印度國防部長費南德斯會面時指出，中共控制疫情方面取得了明顯成效。
