1999年春，朱镕基访问美国，中共对美采取消气外交，其中在进入世界贸易组织问题上的立场，本来是江泽民在事前向朱镕基亲自交代并且明确了的，然而后来发现内部反对声音很大，江泽民却翻脸不认账，让朱镕基单独承担压力，并借此巩固自己的核心地位。
1999年4月25日，北京发生法轮功万人请愿中南海事件。朱镕基在和中南海请愿的法轮功成员对话之前打电话请示过江泽民，本来，在朱镕基和法轮功代表对话后，事情已经顺利解决，可是江泽民却在当天晚上给政治局常委及有关人士写信，对法轮功问题上纲上线，在第二天的政治局常委会上大发雷霆，定下了镇压法轮功的调子。
从四月二十五日到七月中旬，江泽民针对法轮功问题作过大小十三次指示，主持开过多次会议，一手发动了这场被作者称为“建国五十年来规模最大的逮捕行动之一，也是改革开放二十年来最大的一次取缔行动。正如《朱镕基在1999》作者指出的那样，“在一个过份依靠政治运动，法制手段和行政机制都欠完备的国家里，最高领导人通常会使用运动和镇压的手段来达到自己平时比较难以达到的目的----部份原因是为了挤压甚至搞垮对手，更主要的是为了在权力角逐中树立更大的权威”。
稍微留心点的人都注意到，在中共五十周年大庆的天安门城楼上，江泽民踌躇满志，喜形于色，朱镕基却自始至终面无笑容。这也难怪，为了这次大庆，江泽民一下子就挥霍掉一千八百多个亿，朱镕基怎么笑得起来？单单是为了北京市的六七项大工程，朱镕基就不止一次对手下人说到：“美国别说五十年大庆，就是百年大庆，它华盛顿敢这么搞吗？谁搞谁下台。全国老百姓的钱能集中在首都用吗？”
李登辉提出两国论，中共上层反应强烈，个个都表示不惜一战。当有人私下和朱镕基谈到中国历史上的分分合合，屡见不鲜，如今大陆与台湾出现两个政权也没有什么可奇怪的，为什么容不得台湾？朱镕基叹口气说：“为了一个名份啊。”这倒是句大实话。然而，就是为了一个名份搞得两岸关系紧绷，甚至随时有同根相煎、生灵涂炭的危险，那又是何苦呢？
1999年年底，中美双方就中国入世问题达成协议，江泽民又对朱镕基热络起来了。江朱的关系似乎又密切起来了。然而人的本性是很难改变的。你总不能因为打你时恨他，对你笑时就遗忘挨打的痛苦吧？更何况下次他可能还会打你！
明年，朱镕基就要退休离任。在最后的这段时间里，朱镕基还会做些什么呢？莫非他再也没有当年不顾地雷阵、万丈深渊的勇气，只满足于留下一个恐怕连清官都不完整的名声吗？
资料来源(北京之春)
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