示威人士在游行中沿途呼叫"董建华下台"等口号。在离升旗仪式不远处，数十名"四五行动"的成员手持横额和一个墓碑游行示威，抗议香港在主权移交以来政府在人权、法治和民主方面的倒退。曾一度因为警方要求他们改道远离升旗仪式的地点而和警方发生冲突。

示威的高潮是由来自香港30多个不同团体组成的民主联盟举行的游行示威。游行的队伍从香港的维多利亚公园出发，经过湾仔游行到中环的政府总部。参加游行的人数不超过一千人。

走在游行队伍最前面的有民主党立法会议员李柱铭、支联会主席司徒华、职工盟立法会议员刘千石和四五行动的梁荣忠。 游行的队伍高呼要求实行一人一票普选行政长官的口号，也有争取居港权人士参加了游行。有游行人士指出，他们不满主权移交以来政府及特首董建华的表现，他们要求董建华下台及反对他连任。

发起游行的组织在主权移交纪念日前数周，在香港各地收集到将近3万个香港市民的签名，支持实行一人一票普选行政长官。

另外来自香港多个以长者及低收入人士为主的民间团体数十人冒雨在政府总部门前请愿，呼吁政府关注社会低下层人士的生活，改善民生，保护长者权益。特区行政长官董建华亲自接过他们的请愿信，向他们了解诉求。

四千多名香港新界的原居民，也趁机来到香港中环的政府总部示威，要求政府捍卫基本法保障新界原居民传统权益的规定，要求政府废除新界原居民村双村长制。

香港市民在主权移交纪念日所表现出来的不满情绪，与谋求连任的董建华过份献媚北京有关，尤其是在对待法轮功一事上，完全是鹦鹉学舌重复江泽民政府的调调。有谁会支持一个为了个人乌纱帽而失去是非判断能力，黑白不分的傀儡特首连任呢？