清大一位經常出現在臺灣媒體上侃侃而談的教授，在被問及爆炸案情況時，以爆炸案不是他的專業，迴避訪問。而另一位北大教授也以當時他在開會爲由，表示對爆炸案不清楚。
據了解，爆炸案發生後，大批公安人員立即趕到爆炸現場，封鎖現場盤問當時在場人員，同時警方派出專業鑑識人員仔細蒐集相關證據。中共官方新華社及中新社均很快上網報導爆炸案訊息，反而是清大及北大的學生對爆炸案几乎都不願意多談，甚至有一位北大學生說他中午才在那個餐廳吃飯，根本不知道發生了爆炸案，以此作爲搪塞的理由。
由於時值中國大陸人大及政協兩會即將召開之際，中共公安部門號稱已動員近七萬名安全人員維護北京安全，沒想到還發生爆炸案，頗令中共高層顏面無光。據了解，中共高層下令公安部門一定要徹查，否則難保兩會期間不出差錯。
爆炸案發生後消息迅速傳報到中共高層，中國大陸外交部發言人孔泉今天在例行記者會中被媒體問及北大及清大爆炸案時，不願意多談，僅輕描淡寫說，中共警方正在全力調查中。
北大爆炸案發生在中午十三時二十分左右，北京大學農園餐廳北門發生爆炸，造成三人受傷，餐廳二樓天花板及吊燈均被震落，窗戶玻璃被震碎。
清大校園爆炸案發生在中午十一時五十分左右，校園內「荷園」教工餐廳一樓爆炸，造成六人受傷。
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