直到觸及每個人的「靈魂和肉體」 的文化大革命運動開始，他的坐椅也不可避免地被搖晃了一下，但各方面人士也沒有把他看成戰鬥目標。

在文革第二年(1967)，中南海開始揪鬥劉少奇時，紅衛兵小將和中南海「革命」 羣衆也把他揪出去鬥了一下，先批他說他是「軍閥」(因朱在參加中共前，在雲南蔡鍔組織的護法軍中任團長)，這時毛澤東起來替他說話：「他是軍閥該鬥，我這個軍閥政委也該陪鬥。「革命小將」又問他什麼是他一生中最大地遺憾。這些「小將」意思是想讓他說「沒有好好學習毛主席著作」。可他偏偏說：「沒能在我媽臨終前親手端一碗熱粥給她喝」 。毛此時倒也沒怪他，反說：「他真是大老實人」 。由於毛的保駕，所以在文革中他未吃什麼苦。這時因爲他平時也不與人政權奪利的緣故。毛也認爲他即無能力也無野心，決不會危及他的地位，所以還是讓他享清福去吧！

一九七六年一月，周恩來的死對他是個極大地衝擊。從周的遺體告別儀式上也可看出，他伏在周身上嚎啕大哭；他也聽說毛和「四人幫」對周追悼的種種限制，直到當年四月初，北京人趁清明節集聚天安門廣場悼念周恩來，最後又被八三四一部隊和工人民兵武裝鎮壓。

這些不得不使他回憶參加中共，特別是49年中共取得政權後的一幕一幕的黨內高層鬥爭，這時這個老實人才大徹大悟，他鼓足了勇氣在一次中共高層會議上，用柺杖啄着地面忿忿地說：「我糊里糊塗過了一輩子，現在我清醒了，可是已晚了」。這時他已九十高齡了，已經迴天乏力了。自此以後他就搶着接見外賓，想以此來強化自己在國際和國內的影響。可惜說完這話不幾個月就離開了人間。

這裏還有一段永遠不能清楚的歷史懸案，即他最後是以感冒引起的併發症死的。有種傳說是「四人幫」 怕他死在毛澤東以後，以他在黨內，軍內原來的威信，起來把他們打倒，因而通過策劃，趁他在人民大會堂等待接見外賓之機將空調降低，使他感冒，致使這位高齡老人在當年七月六日就帶着終身遺憾棄世而去。

看來這種說法也有一定可信度。因爲他雖體弱多病，但無絕症，而且他僅比毛澤東早死兩個月。