然而，正如武汉大学前校长、教育家刘道玉在给清华的公开信中所说，清华百年校庆没有摆脱“大造舆论，邀请名人捧场，极尽评功摆好之能事”的窠臼，缺乏正筹备150周年校庆的美国麻省理工学院的反思环节。

《苹果日报》消息说，清华最引以为傲的是作为中共高官的摇篮，令中共政坛有“大清帝国北大荒”之说。但再多的高官、再多的高材生、再多的知名学者，也抹不去清华在文化大革命中百日武斗的耻辱一幕。

清华是文革的风暴中心之一，井冈山兵团、百日武斗、五大造反派领袖之一的蒯大富，都是那个年代的经典。但官方在庆祝清华百年校庆时，似乎忘记了 1911年清华学堂的第一任监督（校长）周自齐，更忘记了周自齐的夫人王喜顺在文革时被红卫兵打死、再用菜刀砍下头颅，甚至于在官方、民间有关清华文革非正常死亡的纪录中，也不见有周夫人之名。

周自齐的后人周传基前日在微博重提这段惨剧时，有网民回应称，清华的红卫兵砍掉周夫人的头是清华的耻辱。

文革时清华红卫兵批斗“资产阶级反动学术权威”的真实场面。